Kolokalisaatio mikroskopiassa viittaa erilaisiin data-analyysimenetelmiin, joilla luonnehditaan kuvan kahden kanavan (joita kutsutaan tavallisesti R- ja G-kanaviksi tai punaisiksi ja vihreiksi kanaviksi riippumatta siitä, minkä aallonpituuden ne ovat tosiasiallisesti rekisteröineet) päällekkäisyyden astetta. Tyypillinen sovellus fluoresenssimikroskopiassa on kahden leimatun kohteen läsnäolon tutkiminen solun samalla alueella.
Yhteensopivaa johdantoa varten katso Colocalization Coefficients ja Colocalization Basics.
Mind that Blur And Noise affect Colocalization.
Katso lisätietoja kohdista Kolokalisaatioanalysaattori ja Kolokalisaatioteoria.

Kohteen kolokalisaatio

Huomaa, että Huygens-ohjelmiston kohdeanalysaattorilla voidaan tehdä kolokalisaatiomittauksia myös objektitasolla. Kolokalisaatioanalysaattori toimii enemmän koko kuvan tasolla, vaikka joitakin kolokalisaatioalueiden paikallisia tilastoja voidaankin helposti hakea.
Kumpikin analysaattori toimii tässä mielessä toisiaan täydentävillä tavoilla.

• Objektianalysaattorin avulla voit määritellä objekteja (ks. Objektien segmentointi) ja nähdä, kuinka paljon ne ovat päällekkäisiä tilavuuden tai intensiteetin suhteen. Näin määritellyt objektit voivat olla päällekkäisiä muiden objektien kanssa tai sitten eivät. Voit suodattaa pois objektit, jotka eivät kolokalisaatioidu lainkaan.
• Colocalization Analyzer tutkii koko kuvaa etsiäkseen kolokalisaatioalueita tavanomaisten kolokalisaatiokertoimien perusteella. Nämä alueet segmentoidaan sitten ja käsitellään analysoitavina objekteina. Nämä kohteet ovat siis aina leikkaustilavuuksia.