Haitin virallinen uskonto oli monta vuotta roomalaiskatolisuus. Sen virallinen asema kumottiin vuoden 1987 perustuslain säätämisen myötä, mutta sen enempää hallitus kuin Vatikaanikaan ei ole kuitenkaan irtisanoutunut vuoden 1860 konkordaatista, joka toimii niiden välisten suhteiden perustana. Roomalaiskatolilaisuus säilyttää monin tavoin kunnia-asemansa, mutta haitilaisille taataan perustuslaissa vapaus harjoittaa kaikkia uskontoja. Vuoden 1998 arvioiden mukaan roomalaiskatolisia on noin 80 prosenttia väestöstä. Suurin osa lopuista kuuluu erilaisiin protestanttisiin kirkkokuntiin, joista suurimmat ovat baptistikirkko (10 %) ja helluntaikirkko (4 %). Muita merkittäviä kirkkokuntia ovat metodistit, episkopaalit, Jehovan todistajat, mormonit, adventistit ja ortodoksit. Muita uskonnollisia ryhmiä ovat juutalaiset, muslimit, rastafarit ja bahait. Voodoota, perinteistä uskontoa, joka on osittain peräisin länsiafrikkalaisista uskomuksista, harjoitetaan edelleen laajalti, usein yhdessä kristinuskon kanssa. Voodoosta tuli virallisesti tunnustettu kirkko vuonna 2001, kun Eglise Voudou d’Ayiti (Haitin voodoo-kirkko) perustettiin, ja sen kävijämäärä on kasvanut siitä lähtien.