SeuraEdit
Real MadridEdit
Fernando syntyi Málagassa, Andalusiassa. Aloitettuaan kotikaupunkinsa Málaga CF:ssä hän päätti jalkapallokasvatuksensa La Ligan jättiläisen Real Madridin riveissä esiintyen kerran sen ykkösjoukkueessa kaudella 1999-2000 Real Zaragozaa vastaan (90 minuuttia, 1-0 kotivoitto).
Sen jälkeen Fernando siirtyi lainalle Real Valladolidiin, sillä monet Real Madridin canteranot siirtyisivät tuohon seuraan tuona aikana (Alberto Marcos, Víctor, José García Calvo, jne.).
BetisEdit
Kesällä 2002 Fernando allekirjoitti sopimuksen Real Betisin kanssa ja teki debyyttikautensa aikana 15 maalia, ja joukkue sijoittui kahdeksannelle sijalle paljolti Málagaa (3-0), RCD Espanyolia (4-2) ja Real Sociedadia (3-2) vastaan tekemiensä vapareiden ansiosta. Hän voitti uransa ainoan pokaalin vuonna 2005, 2-1 Copa del Rey -voiton CA Osasunasta.
27. kesäkuuta 2008, koska hänen roolinsa oli vähäisempi vuosina 2005-2008 – vain kymmenen ottelua viimeisellä kaudellaan – Fernando allekirjoitti nelivuotisen sopimuksen Málagan kanssa ja palasi 11 vuoden jälkeen ensimmäiseen nuorisoseuraansa.
Málaga ja myöhemmät vuodetEdit
Fernando teki ensimmäisen liigamaalinsa Málagalle 23. syyskuuta 2009 Espanyolia vastaan, yli vuosi saapumisensa jälkeen; tämä tapahtui kuitenkin 1-2 vierastappiossa. Debyyttikaudellaan säästeliäästi käytetty, hänestä tuli aloittaja kaudella 2009-10, jolloin hän teki viisi maalia.
Fernando jatkoi aloituskokoonpanoissa kaudella 2010-11, uuden managerin Jesualdo Ferreiran alaisuudessa. Toisena pelipäivänä hän teki kaksi maalia 5-3-voitossa Zaragozasta, ensimmäisen maalin vain 73 sekunnin jälkeen. Seuraavan valmentajan Manuel Pellegrinin harvoin käyttämänä hän oli silti mukana 21 ottelussa, kun Boquerones lopulta vältti putoamisen.
21. elokuuta 2011 32-vuotias Fernando vapautettiin sopimuksestaan. Hän siirtyi ensimmäistä kertaa ulkomaille seuraavan vuoden helmikuun 4. päivänä liittyen useiden maanmiestensä seuraan Unkarin Diósgyőri VTK:hon. Hän lopetti jalkapalloilun kesäkuussa 2013.
KansainvälinenEdit
Fernando voitti neljä maajoukkuepeliä alle 21-vuotiaiden maajoukkueessa Espanjassa, kuudessa kuukaudessa. Ensimmäisen hän sai 27. helmikuuta 2001, jolloin hän pelasi toisen puoliajan 4-0 ystävyysottelussa Englantia vastaan Birminghamissa.