Julkaisut

Varhaisessa teoksessaan, lääketieteellisessä traktaatissa maidon hyvistä puolista, Libellus de lacte et operibus lactariis (1545), hän sisällytti ystävälleen osoitetun kirjeen, jossa hän ylistää vuoria yhtenä luonnon suurimmista ihmeistä. Tämä maininta ja myöhempi kertomus hänen Pilatus-vuoren kiipeilystään (1555) ovat ensimmäisiä merkintöjä vuorikiipeilystä.

Gesner julkaisi vuonna 1545 Bibliotheca universalis -teoksensa, joka oli ensimmäinen laatuaan ja jossa lueteltiin aakkosjärjestyksessä noin 1800 kirjailijaa ja heidän teostensa otsikot, huomautukset, arviot ja kommentit kunkin merkinnän luonteesta ja ansioista. Tätä monumentaalista hakuteosta seurasi vuonna 1548 ensyklopedinen teos Pandectarum sive Partitionum universalium Conradi Gesneri…libri xxi, jossa Gesner pyrki kartoittamaan maailman kirjatun tiedon 21 otsikon alla. Ensimmäiset 19 kirjaa julkaistiin vuonna 1548; viimeinen, teologiselle ajattelulle omistettu kirja julkaistiin vuonna 1549, kun taas 20. kirja, joka käsitteli lääketiedettä, ei koskaan valmistunut.

Gesnerin seuraava monumentaalinen saavutus oli eläinkuntaa koskevan kirjatun tiedon kompendium, Historiae animalium, jossa hän pyrki erottamaan havaitut tosiasiat myyteistä ja kansantajuisista virheistä. Ensimmäinen nide (1551), runsaasti kuvitettu 1 100 foliosivun teos, käsitteli eläviä nelijalkaisia (nelijalkaisia eläimiä, jotka synnyttävät eläviä poikasia). Myöhemmin, vuosina 1554, 1555 ja 1556 julkaistiin niteet, jotka oli omistettu muniville nelivarvaseläimille (ne, jotka hautovat poikaset munista), linnuille sekä kaloille ja muille vesieläimille; osittain valmistunut viides nide, joka käsitteli käärmeitä, julkaistiin postuumisti vuonna 1587.

Gesner ei koskaan saanut valmiiksi yhtä laajaa katsausta kasveista, mutta hänen muistiinpanojaan ja noin 1500 puupiirrosta kasveista ja niiden tärkeistä kukista ja siemenistä hyödynsivät muut kirjailijat kaksi vuosisataa hänen kuolemansa jälkeen. Vaikka Gesner tunnettiinkin omana elinaikanaan parhaiten kasvitieteellisistä teoksistaan, hän julkaisi myös Mithridates: de differentis linguis (1555), joka käsitteli noin 130 tuolloin tunnettua kieltä, sekä painoksen (1556) 3. vuosisadan roomalaisen sekalaiskirjailijan Claudius Aelianin teoksista.