Amazonian manaatit ovat kasvinsyöjiä, joten niillä ei ole viilto- tai syömähampaita, mutta niillä on hyvin varustetut poskihampaat, jotka on suunniteltu murskaamaan vedenalaista kasvillisuutta. Kummallista kyllä, ja toisin kuin muilla nisäkkäillä, Amazonin manaatit näyttävät uudistavan poskihampaat leukojensa takaosassa. Ulos putoavat kuluneet poskihampaat korvautuvat nopeasti upouusilla poskihampailla, jotka siirtyvät eteenpäin ja peittävät aukot.

Neidän luonteensa on yhtä suloinen kuin niiden kasvotkin, ja ne ovat rauhallisia eläimiä, jotka suosivat rauhallisempia mustavesi-järviä ja laguuneja. Näillä alueilla on runsaasti vedenalaista kasvillisuutta, jota ne voivat syödä. Kun kuiva kausi saapuu ja tulviva sademetsävesi vetäytyy Amazonin manaatit voivat paastota viikkoja tai kuukausia, jos kasvillisuus on niukkaa. Niiden suosima ruokavalio sisältää vesikasvillisuutta ja puolivesikasvillisuutta, kuten ruohoja, vesisalaattia, rakkolehdokkia, sarvivälkkiä, vesililjoja ja vesihyasintteja, ja jos veteen putoaa palmun hedelmiä, ne syövät myös niitä. Keskimääräisenä päivänä Amazonin manaatti voi syödä jopa 5-18 prosenttia ruumiinpainostaan. Jos paastoaminen on välttämätöntä, niiden rasvavarastot ja alhainen aineenvaihduntanopeus mahdollistavat sen, että Amazonin manaatti voi selviytyä jopa seitsemän kuukautta ilman tai vähällä ravinnolla.

Yksinäisenä eläimenä se vaeltaa koko Amazonin altaan alueella, ja sen voi havaita Ecuadorissa, Kolumbiassa, Perussa, Boliviassa, Venezuelassa, Guyanassa ja Brasiliassa. Joskus yksinäinen manaatti voidaan tavata jopa kahdeksan yksilön ryhmissä. Niitä voi tavata ruokailemassa järvien ja jokien pinnalla. Vierailijat huomaavat todennäköisesti ensimmäisenä manaatin nenän, sillä se nousee neljän minuutin välein esiin hakemaan raitista ilmaa, nenä edellä. Toisin kuin kansainväliset serkkunsa, Amazonin manaatit asuvat yksinomaan makean veden ympäristöissä.

Ruokaa etsiessään Amazonin manaatit seuraavat Amazoninjoen kausittaisia liikkeitä. Märkänä vuodenaikana manaatit siirtyvät kohti tulva-alueita, jotka ovat ravinteikkaita ja joissa on runsaasti kasvillisuutta, sen sijaan kuivana vuodenaikana ne siirtyvät syvemmille vesille.

Amazonialaiset manaatit lisääntyvät kausittain vedenpinnan noustessa. Ecuadorissa on raportoitu eniten synnytyksiä tammikuun ja kesäkuun aikana, mutta yleisesti ottaen synnytyksiä näyttää tapahtuvan usein joulukuun ja heinäkuun välisenä aikana, eniten helmi-toukokuun aikana. Tiineysaika on kahdestatoista neljästätoista kuukaudesta, ja naaraat saavat yleensä uuden poikasen kahden vuoden välein. Kun poikaset ovat syntyneet, niitä kannetaan emon selässä tai ne uivat lähellä emon kylkeä.

Amazonian manaatit säätelevät ruumiinlämpöään erikoisella tavalla. Niiden verisuonissa olevat sulkijalihakset ohjaavat verenkiertoa alueille, jotka ovat läheisessä kosketuksessa veden kanssa. Lisäksi ne käyttävät ruumiinsa rasvaa vähentääkseen lämmönhukkaa. Tämä on erityisen hyödyllistä niiden iltaruokaa metsästäessä, sillä Amazonin manaatit ovat sekä päivä- että yöeläimiä.

Amazonialaisen manaatin luonnollisiin saalistajiin kuuluvat hait, krokotiilit ja jaguaarit. Valitettavasti manaatin rasvaa ja lihaa arvostavat suuresti ihmismetsästäjät, jotka jahtaavat hitaasti liikkuvaa eläintä järvien ja purojen poikki. Ecuadorissa manaattien tarkkaa lukumäärää ei tiedetä, mutta niiden uskotaan olevan erittäin uhanalaisia elinympäristön häviämisen, kalastuksen sekä öljynporaushankkeiden ja öljyvuotojen aiheuttaman saastumisen vuoksi. Omalla tavallaan kaunis Amazonin manaatti on haavoittuva laji, joka hyötyisi suuresti kaikkien vierailijoiden, niin paikallisten kuin ulkomaistenkin, tuesta.